PCR基因擴增實驗室
PCR基因擴增實驗室介紹和標(biāo)準(zhǔn):
PCR實驗室又叫基因擴增實驗室。PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction)的簡稱。是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。通過DNA基因追蹤系統(tǒng),能迅速掌握患者體內(nèi)的病毒含量,其精確度高達納米級別。
PCR實驗室必須建立嚴(yán)格的實驗室管理制度、建立標(biāo)準(zhǔn)化操作程序(SOP)、建立系列質(zhì)量管理文件等,確保實驗室日常運行符合國家衛(wèi)生部的要求,確保檢測結(jié)果準(zhǔn)確、確保實驗室衛(wèi)生安全,確保實驗室長期穩(wěn)定運行.
PCR設(shè)計規(guī)范/PRINCIPLES
配置原則 | 室全PCR線實驗(高檔實驗室) | 標(biāo)準(zhǔn)PCR實驗室(中檔實驗室) | 普通實驗室(普通實驗室) | 測序?qū)嶒炇遥▽?茖嶒炇遥?/span> |
開展項目 | 涵蓋了目前分子生物學(xué)能開展所有項目,達到國內(nèi)甚至 一流CR實驗室水平。 | 檢測項目齊全,涵蓋了目前臨床需求的常規(guī)檢測項目,達到國內(nèi)PCR標(biāo)準(zhǔn)實驗室的檢測水平。 | 臨床科室或小型醫(yī)院開展PCR項目,檢測項目滿足臨床需求,達到或達不到國內(nèi)PCR標(biāo)準(zhǔn)實驗室的標(biāo)準(zhǔn)。 | 開展測序的所有檢測項目,達到標(biāo)準(zhǔn)PCR實驗室水平 |
項目 性 | 除開展常規(guī)的檢測項目外,還需開展高端項目,如測序項目、超敏PCR項目、腫瘤檢測等高端項目。 | 開展項目技術(shù)性能基本滿足臨床需求,達到國內(nèi)PCR標(biāo)準(zhǔn)實驗室的檢測水平。 | 開展項目技術(shù)性只能滿足科室或小型醫(yī)院的當(dāng)前需求,不具有 性。 | PCR測序檢測項目,達到個體化診療的需求。 |
人員要求 | 至少有兩人,除經(jīng)過普通PCR上崗培訓(xùn)外,要具有測序項目檢測實驗及結(jié)果分析能力。 | 至少有兩人,除經(jīng)過普通PCR上崗培訓(xùn)外,要具有測序項目檢測實驗及結(jié)果分析能力。 | 至少有兩人,除經(jīng)過普通PCR上崗培訓(xùn)外,要具有測序項目檢測實驗及結(jié)果分析能力。 |
至少有兩人,除經(jīng)過普通PCR上崗培訓(xùn)外,要具有測序項目檢測實驗及結(jié)果分析能力。 |
PCR基因擴增實驗室技術(shù)參數(shù):
區(qū)域 | 壓力 | 溫度 | 相對濕度 | 照明 |
PCR走廊 | +5-0Pa | 20-26度 | 40-60%RH | 主實驗室≥300LX,其余房間20-300LX |
PCR試劑準(zhǔn)備區(qū) | +10Pa | |||
PCR樣品制備區(qū) | +15Pa | |||
PCR擴增及擴增產(chǎn)物分析區(qū) | -15-250Pa |
基因擴增檢驗實驗室平面布局
1)臨床基因擴增檢驗實驗室區(qū)域設(shè)置原則
1、 試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū) 2、 標(biāo)本制備區(qū)
3、 擴增反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū) 4、 擴增產(chǎn)物分析區(qū)
如使用全自動分析儀,區(qū)域可適當(dāng)合并。
2)各工作區(qū)域必須有明確的標(biāo)記,避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。
3)進入各工作區(qū)域必須嚴(yán)格按照單一方向進行,即試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)—>標(biāo)本制備區(qū)—>擴增反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū)—>擴增產(chǎn)物分析區(qū)。
4)不同的工作區(qū)域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區(qū)域時,不得將工作服帶出。
PCR基因擴增實驗室平面圖
PCR擴增檢驗實驗室原則上分為三個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴增和擴增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴增和擴增產(chǎn)物分析區(qū)。各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應(yīng)通過傳遞窗進行。
(1)試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)
該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應(yīng)直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區(qū)應(yīng)對外界保持微正壓。
(2)標(biāo)本制備區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應(yīng)管和測定DNA的合成。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
(3-4)擴增和擴增產(chǎn)物分析區(qū)
該區(qū)域主要進行的操作為DNA擴增和擴增片段的測定。此外,已制備的DNA模板(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺內(nèi)進行。
PCR區(qū)完成以后,需要分析樣品并解釋數(shù)據(jù),應(yīng)該留出一個專門用于反應(yīng)后處理樣品的地方。后PCR活動中使用的所用試劑、一次性耗材和儀器都必須是專門用于這一目的,決不能把實驗室這一區(qū)域的試劑或儀器用于任何前PCR活動。產(chǎn)物分析區(qū)如使用全自動分析儀,區(qū)域可適當(dāng)合并。
(5)緩沖區(qū)與沖洗區(qū)
整個區(qū)域有一個整體緩沖走廊。每個獨立實驗區(qū)設(shè)置有緩沖區(qū),同時各區(qū)通過氣壓調(diào)節(jié),使整個PCR實驗過程中試劑和標(biāo)本免受氣溶膠的污染并降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。
可打開緩沖區(qū)Ⅰ,緩沖區(qū)Ⅱ和PCR擴增區(qū)的排風(fēng)扇往外排氣,在實驗區(qū)的外墻上和各扇門上都安裝有風(fēng)量可調(diào)的回風(fēng)口,空氣通過回風(fēng)口向室內(nèi)換氣。外面有用于實驗后消毒,消毒區(qū)域有專用清洗液和專用潔凈洗手池,以及消毒紙巾。
若房間進深允許,可設(shè)PCR內(nèi)部專用走廊。需要指出的是在減少室內(nèi)外空氣交換方面,緩沖間比專用走廊更有意義。
各個區(qū)域之間應(yīng)具備單向的實驗工藝流、物流、人流與氣流,形成單向流程的保護屏障,避免實驗之間的相互干擾,防止核酸氣溶膠對實驗過程造成污染產(chǎn)生假性結(jié)果。
PCR實驗室案例欣賞
以下為科瓦特設(shè)計的疾控中心PCR基因擴增實驗室的整體建設(shè):
1、主體結(jié)構(gòu):
主體為彩鋼板、鋁合金型材。室內(nèi)所有陰角、陽角均采用鋁合金50內(nèi)圓角鋁,從而解決容易污染、積塵、不易清掃等問題。結(jié)構(gòu)牢固,線條簡明,美觀大方,密封性好。
2、標(biāo)準(zhǔn)的三區(qū)分隔和氣壓調(diào)節(jié):
將PCR過程分成試劑準(zhǔn)備、標(biāo)本制備和PCR擴增、分析三個(或)四個獨立的實驗區(qū)。整個區(qū)域有一個整體緩沖走廊。每個獨立實驗區(qū)設(shè)置有緩沖區(qū),同時各區(qū)通過氣壓調(diào)節(jié),使整個PCR實驗過程中試劑和標(biāo)本免受氣溶膠的污染并降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。
可打開緩沖區(qū)Ⅰ,緩沖區(qū)Ⅱ和PCR擴增區(qū)的排風(fēng)扇往外排氣,在實驗區(qū)的外墻上和各扇門上都安裝有風(fēng)量可調(diào)的回風(fēng)口,空氣通過回風(fēng)口向室內(nèi)換氣。
3、消毒:
在三個實驗區(qū)和三個緩沖區(qū)頂部以及傳送窗內(nèi)部安裝有紫外燈,供消毒用。在試劑準(zhǔn)備區(qū)和標(biāo)本制備區(qū)還設(shè)置移動紫外線燈,對實驗桌進行局部消毒。
4、機械連鎖不銹鋼傳遞窗:
試劑和標(biāo)本通過機械連鎖不銹鋼(不建議使用電子連鎖方式)傳遞窗傳遞,保證試劑和標(biāo)本在傳遞過程中不受污染(人物分流)。
5、地面
地面建議使用PVC卷材地面或自流坪地面,整體性好。便于進行清掃,耐腐蝕。沒有條件的也可采用水磨石地面,或大塊的瓷磚(至少800mm×800mm)接縫需要小于2mm。
6、照明
燈具要選用凈化燈具,能達到便于清洗、不積塵的特點。
科瓦特PCR實驗室案例展示:
生物安全標(biāo)識 產(chǎn)物擴增區(qū)
PCR標(biāo)本制備區(qū) PCR緩沖區(qū)
PCR洗手消毒區(qū) PCR沐浴換衣區(qū)
PCR通風(fēng)與消防區(qū) (不同區(qū)域工作人員衣服不同) PCR負壓控制區(qū)
在建設(shè)的過程中應(yīng)注意:
●規(guī)范的安裝流程和全面的服務(wù)流程。
●嚴(yán)格按照規(guī)范科學(xué)設(shè)計的安裝流程。
●安裝前需要確定以下安裝條件,如:電源電壓,電源進線位置,電話網(wǎng)絡(luò)線進線位置,進水水壓,最小安裝空間,地面平整度,通風(fēng)孔、進水管和下水管的位置等,理想狀態(tài)的空間尺寸和通風(fēng)口尺寸。
PCR即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是分子生物學(xué)研究和實驗的常規(guī)方法,也是生物學(xué)、醫(yī)學(xué)臨床等領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的實驗技術(shù)。其特點是能將微量的DNA大幅增加。實驗室分為四個區(qū)域,進入各工作區(qū)域必須嚴(yán)格按照單一方向進行,不同的工作區(qū)域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開各工作區(qū)域時,不得將工作服帶出,
PCR整體實驗室區(qū)域分別為:
1.試劑配制區(qū)
2.樣品處理區(qū)
3.核酸擴增區(qū)
PCR實驗室可以是分散形式,也可以是組合形式。完成一組PCR實驗,通常應(yīng)經(jīng)過試劑配制、樣品處理、核酸擴增及產(chǎn)物分析四個實驗過程,若實驗工藝需要,還應(yīng)增加樣品粉碎過程。
一、分散形式PCR實驗室
所謂分散形式PCR實驗室,是指完成上述實驗過程的實驗用房彼此相距較遠,呈分散布置形式。對于這種布置形式的PCR實驗室,由于各個實驗之間不易相互干擾,因此無需特殊條件要求。
二、組合形式PCR實驗室
所謂組合形式PCR實驗室,是指完成PCR四個實驗過程的實驗用房相鄰布置,組成獨立實驗區(qū)域的形式。對于組合形式PCR實驗室,由于各個實驗間集中布置,容易造成相互干擾,因此,對總體布局以及屏障系統(tǒng)具有一定的要求。各室在入口處設(shè)緩沖間,以減少室內(nèi)外空氣交換。試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓,以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成污染;核酸擴增室及產(chǎn)物分析室應(yīng)呈微負壓,以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品。
如果使用熒光PCR儀,擴增室和產(chǎn)物分析室可以合并。
若房間進深允許,可設(shè)PCR內(nèi)部專用走廊。需要指出的是在減少室內(nèi)外空氣交換方面,緩沖間比專用走廊更有意義。
各個區(qū)域之間應(yīng)具備單向的實驗工藝流、物流、人流與氣流,形成單向流程的保護屏障,避免實驗之間的相互干擾,防止核酸氣溶膠對實驗過程造成污染產(chǎn)生假性結(jié)果。
實驗室的墻體,包括頂棚,應(yīng)結(jié)構(gòu)牢固、氣密性好;所有陰角宜采用圓弧形線條過渡;墻體內(nèi)壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒;地面材料應(yīng)滿足無縫隙、無滲漏、光潔、耐腐蝕的要求.。
擬設(shè)置臨床基因擴增檢驗實驗室的醫(yī)療機構(gòu)按照《臨床基因擴增檢驗實驗室基本設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)》籌建實驗室;籌建完成后,由法定代表人向衛(wèi)生部臨檢中心提出技術(shù)驗收申請。
申請時需提交以下材料:
(一)《醫(yī)療機構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證》復(fù)印件;
(二)可行性研究報告;
1、擬設(shè)臨床基因擴增檢驗實驗室機構(gòu)的所在地醫(yī)療衛(wèi)生資源狀況、本機構(gòu)的基本情況、對臨床基因擴增檢驗的需求以及臨床基因擴增實驗室運行的預(yù)測分析;
2、擬設(shè)臨床基因擴增檢驗實驗室的設(shè)置平面圖;
3、擬設(shè)臨床基因擴增檢驗實驗室將開展的檢驗項目、實驗設(shè)備條件和有關(guān)技術(shù)人員資料
PCR實驗室驗收條件:
1根據(jù)衛(wèi)生部臨檢中心規(guī)定,凡是根據(jù)需要開展PCR檢測實驗室建設(shè)的醫(yī)療機構(gòu)均通過衛(wèi)生臨床檢驗中心實驗室驗收并取得合格證書方可開展工作。二級以上醫(yī)院方可設(shè)立PCR實驗室,含??漆t(yī)院。
2驗收規(guī)定:
三級醫(yī)院由衛(wèi)生部臨床檢驗中心組織專家(一般均為各省臨床檢驗中心主任)進行,二級醫(yī)院由各個省臨床檢驗中心組織專家(一般為本省醫(yī)療機構(gòu)主任級別專家)進行驗收。按照《臨床基因擴增檢驗實驗室基本設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)》對提出申請的臨床基因擴增檢驗實驗室進行技術(shù)驗收。驗收完成后,在20日內(nèi)將驗收報告寄送至申請機構(gòu)。
驗收人員組成:一個驗收小組一般為3人,其中一人為聯(lián)絡(luò)小組組長,其他為其他省臨床檢驗中心主任或者本省醫(yī)院內(nèi)任職專家。
PCR實驗室所在科室規(guī)定:根據(jù)規(guī)定,PCR檢測應(yīng)該由各醫(yī)院的檢驗科開展,其他科室如傳染科,皮膚科等,要求開展并申請驗收的,應(yīng)該事先由各省臨床檢驗中心認(rèn)可。
PCR實驗室人員規(guī)定:根據(jù)規(guī)定,PCR實驗室操作人員至少2名,且有PCR上崗培訓(xùn)合格證。
PCR實驗室設(shè)備:PCR實驗室內(nèi)所需要的醫(yī)療設(shè)備均需要取得相關(guān)醫(yī)療器械注冊許可證,檢測試劑均需要取得新藥證書和藥品生產(chǎn)文號,熒光定量PCR不得使用超過五年。
PCR實驗室認(rèn)證實施規(guī)定:
PCR實驗室認(rèn)證驗收時,均會給定未知標(biāo)本5份(一般是HBV-DNA,可能是近一兩年的衛(wèi)生部臨床檢驗中心室間質(zhì)控品),要求待認(rèn)證實驗室做實驗并打印報告單作為驗收的重要實驗依據(jù)。一般要求5份標(biāo)本的定量結(jié)果必須在范圍值之內(nèi),否則不合格。
PCR實驗室各區(qū)域管理規(guī)定:
試劑準(zhǔn)備區(qū)工作制度
一、實驗人員進入該區(qū)須更換工作服,穿本區(qū)專用綠色工作服,戴帽子、口罩及更換專用拖鞋。
二、實驗員在試劑準(zhǔn)備區(qū)接收標(biāo)本、準(zhǔn)備實驗用的試劑。
三、實驗員每天收齊標(biāo)本,驗收登記后,將標(biāo)本通過傳遞窗送入標(biāo)本制備區(qū)。四、在試劑準(zhǔn)備區(qū)配置好試劑后放入冰箱內(nèi)備用。需要時通過傳遞窗送入標(biāo)本制備區(qū)。
五、每天的標(biāo)本及配置的試劑須登記記錄,應(yīng)書寫工整詳細,使用本區(qū)專用的、帶有本室標(biāo)識的記錄本、紙和筆。
六、將本區(qū)廢棄物裝入本室垃圾袋中,有專人將垃圾帶出實驗室交醫(yī)院集中處理。
七、實驗后須使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭實驗臺面,紫外燈消毒30分鐘,記錄紫外燈、冰箱、離心機等儀器的使用情況。
標(biāo)本制備區(qū)工作制度
一、實驗人員進入該區(qū)須更換工作服,穿上本區(qū)專用藍色工作服,戴帽子、口罩及更換專用拖鞋。
二、把已準(zhǔn)備好的試劑放入冰箱試劑存放專區(qū)暫存。
三、記錄溫濕度計讀數(shù)、冰箱的溫度。
四、嚴(yán)格按照SOP文件及試劑盒要求進行實驗操作,加樣好的PCR管須通過傳遞窗送入擴增及產(chǎn)物區(qū)。
五、使用本區(qū)專用的移液器及吸頭,使用過的離心管、吸頭須置于盛有含氯消毒液的廢液缸中,實驗完畢后及時處理。將本區(qū)廢棄物裝入本室垃圾袋中,有專人將垃圾帶出實驗室交醫(yī)院集中處理。
六、使用本區(qū)專用的帶有本區(qū)標(biāo)識的記錄本、紙和筆,其他區(qū)的用品不得帶入本區(qū)。
七、實驗完畢關(guān)閉所有儀器,記錄儀器使用時間和運行狀態(tài)。
八、實驗后須使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭實驗臺面,紫外燈消毒30分鐘,記錄紫外燈、冰箱、離心機等儀器的使用情況。
擴增及產(chǎn)物分析區(qū)工作制度
一、實驗人員進入該區(qū)須更換工作服,穿上本區(qū)專用粉紅色工作服,戴帽子、口罩及更換專用拖鞋。
二、記錄溫濕度計讀數(shù)、冰箱的溫度。
三、本區(qū)主要進行目的基因的擴增及分析,須熟悉各擴增儀的使用,擴增分析完后,記錄結(jié)果。
四、得到當(dāng)天室內(nèi)質(zhì)控結(jié)果后,及時記錄在室內(nèi)質(zhì)控圖上并進行分析。
五、試驗完畢后關(guān)掉擴增儀,記錄儀器使用時間和運行狀態(tài)。
六、每周由實驗室負責(zé)人對進行清潔維護并記錄。
七、擴增分析完后的反應(yīng)管,須裝入本室垃圾袋中,有專人將垃圾帶出實驗室交醫(yī)院集中處理。
八、使用本區(qū)專用的帶有本區(qū)標(biāo)識的記錄本、紙和筆,其他區(qū)的用品不得帶入本區(qū)。
九、實驗后須使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭實驗臺面,紫外燈消毒30分鐘,記錄紫外燈、冰箱、離心機等儀器的使用情況。
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